Здравствуйте, Владимир.
Прошу прощения, но я сразу укажу на явные ошибки с Вашей стороны.
1. Если сама скважина диаметром в 40 мм, то диаметр труб всей всасывающей линии должен быть таким же или незначительно отличаться, т.е. быть 40 мм или 32 мм, но никак не 20 мм - это мало. Насос не сможет ничего сделать просто из-за нехорошего соотношения объемов заполнения труб водой и воздухом. Поэтому у Вас вода в скважине просто не успевает подняться.
2. Если Вы не хотите делать постоянную линию рециркуляции для пополнения емкости гидрозатвора, то тогда хотя бы при первом пуске насоса нужно как-то предусмотреть замещение воздуха в емкости водой, пока Вы просто выкачиваете из скважины воздух. Например, поставить на всасывающую линию между емкостью и скважиной - кран (штатно, это должен делать обратный клапан, но его можно поставить и после емкости). И при первом включении насоса через несколько секунд перекрыть его, чтобы поднявшаяся в скважине вода не смогла опуститься. Остановить насос, дополнить емкость водой и снова включить насос. И так далее, пока весь воздух из скважины не будет удален.
После этого, по идее, если все соединения, а так же обсадная труба скважины, действительно герметичны, необходимость в пополнении емкости и манипуляциях с краном отпадет. И их нужно будет использовать только в случаях повторного завоздушивания скважины.
К слову, действуя по приведенному алгоритму, можно подсосать воду и с трубой в 20 мм, только это будет дольше, а производительность насоса при этом будет страдать. Такая же фигня будет если не использовать емкость гидрозатвора в схеме всасывающей линии.
Дальше же эта емкость будет некоторым гарантом того, что насос сможет поднять воду из скважины даже при наличии в ней некоторого количества воздуха (идеальных соединений не бывает, да и ошибки полностью исключать нельзя). Просто нужно будет как-то следить за уровнем воды в ней, периодически пополняя её водой.
Так что давайте не будем паниковать раньше времени и попробуем все сделать с учетом знаний законов физики. Должно все получится.